השתתפות חברות התרופות בסל התרופות זינקה מ-5% בשנה 2012 ל-56% בשנת 2017, כך שמיליארד שקל מתקצוב התרופות החדשות שנכנסו לסל הממלכתי בתקופה הזאת שולמו ישירות או בעקיפין על ידי חברות התרופות והטכנולוגיות הרפואיות ולא על ידי משרד הבריאות או קופות החולים. כך מדווח הבוקר (א') "ישראל היום". הכתב רן רזניק ציין כי אלה הם נתונים פנימיים של משרד הבריאות לצד הערכות של בכירים במשרד, בקופות החולים ובחברות התרופות.
עוד בעניין דומה
בדיווח מצוטט המבקר הפנימי לשעבר של משרד הבריאות אריה פז: "ההסכמים אמנם מצליחים להביא תקציבים נוספים לסל, אבל יש בהם חשש לבעייתיות גדולה מאוד בכך שהם מביאים לכניסה מסוכנת של האינטרסים של חברות התרופות היישר לתוך לב מערכת הבריאות הציבורית בקופות החולים ובמשרד הבריאות. יש גם חשש לניגוד עניינים מובנה. זו למעשה הפרטה זוחלת של סל התרופות הממלכתי. היא נעשית ללא החלטה או אחרי דיון ציבורי״. בדיווח נמסר כי קיימים "הסכמים מיוחדים וחסויים בין משרד הבריאות, קופות החולים לבין חברות התרופות". אלה כוללים העברה של תשלומים מחברות התרופות ישירות לקופות החולים, בהיקף של כ־400-300 מיליון שקל עבור מימון התרופות החדשות לחולים. ההסכמים כוללים גם הנחות מיוחדות על מחירי התרופות החדשות בהיקף של עוד כ־600 מיליון שקל שגם אותם מחשב משרד הבריאות כהעברה עקיפה של תקציב לסל התרופות.